MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 137095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002944	CTGT	2	8	37653	37660	0 %	50 %	25 %	25 %	41406129
1002	NC_002944	GCG	2	6	37677	37682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406129
1003	NC_002944	GCCC	2	8	37791	37798	0 %	0 %	25 %	75 %	41406129
1004	NC_002944	CG	3	6	37809	37814	0 %	0 %	50 %	50 %	41406129
1005	NC_002944	CGGC	2	8	37830	37837	0 %	0 %	50 %	50 %	41406129
1006	NC_002944	GCG	2	6	37859	37864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406129
1007	NC_002944	TACC	2	8	37909	37916	25 %	25 %	0 %	50 %	41406130
1008	NC_002944	CGG	2	6	37917	37922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406130
1009	NC_002944	GCA	2	6	37925	37930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406130
1010	NC_002944	GGC	2	6	37983	37988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406130
1011	NC_002944	CAC	2	6	38061	38066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406130
1012	NC_002944	GCG	3	9	38072	38080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406130
1013	NC_002944	GAC	2	6	38109	38114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406130
1014	NC_002944	GAT	2	6	38186	38191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406130
1015	NC_002944	CACC	2	8	38206	38213	25 %	0 %	0 %	75 %	41406130
1016	NC_002944	GC	3	6	38227	38232	0 %	0 %	50 %	50 %	41406130
1017	NC_002944	GGC	2	6	38259	38264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406130
1018	NC_002944	GTT	2	6	38304	38309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406130
1019	NC_002944	GCC	2	6	38311	38316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406130
1020	NC_002944	CGCC	2	8	38325	38332	0 %	0 %	25 %	75 %	41406130
1021	NC_002944	GAT	2	6	38403	38408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406130
1022	NC_002944	GCC	2	6	38461	38466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406130
1023	NC_002944	CCA	2	6	38492	38497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406130
1024	NC_002944	CAG	2	6	38607	38612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406130
1025	NC_002944	GGC	2	6	38616	38621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406130
1026	NC_002944	GCC	2	6	38715	38720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406130
1027	NC_002944	CAC	2	6	38724	38729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406130
1028	NC_002944	CTC	2	6	38757	38762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406130
1029	NC_002944	ACC	2	6	38767	38772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406130
1030	NC_002944	GCC	2	6	38799	38804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406130
1031	NC_002944	GAT	2	6	38832	38837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406130
1032	NC_002944	TCG	2	6	38842	38847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406130
1033	NC_002944	CGG	2	6	38854	38859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406130
1034	NC_002944	GCC	2	6	38889	38894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406130
1035	NC_002944	GCC	2	6	38917	38922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406130
1036	NC_002944	CAGCGC	2	12	39006	39017	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	41406130
1037	NC_002944	CTC	2	6	39063	39068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406130
1038	NC_002944	GCC	2	6	39148	39153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406130
1039	NC_002944	TCC	2	6	39154	39159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406130
1040	NC_002944	CGTG	2	8	39233	39240	0 %	25 %	50 %	25 %	41406130
1041	NC_002944	GCG	2	6	39373	39378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_002944	GGC	2	6	39387	39392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406131
1043	NC_002944	GCA	2	6	39425	39430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406131
1044	NC_002944	GCG	2	6	39442	39447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406131
1045	NC_002944	CAG	2	6	39471	39476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406131
1046	NC_002944	CGC	2	6	39477	39482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406131
1047	NC_002944	GATGC	2	10	39517	39526	20 %	20 %	40 %	20 %	41406131
1048	NC_002944	GCA	2	6	39530	39535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406131
1049	NC_002944	GCT	2	6	39554	39559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406131
1050	NC_002944	GCC	2	6	39576	39581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406131
1051	NC_002944	CTC	2	6	39612	39617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406131
1052	NC_002944	GC	3	6	39687	39692	0 %	0 %	50 %	50 %	41406131
1053	NC_002944	CG	3	6	39714	39719	0 %	0 %	50 %	50 %	41406131
1054	NC_002944	CAC	2	6	39737	39742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406131
1055	NC_002944	CGT	3	9	39743	39751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406131
1056	NC_002944	GCC	2	6	39919	39924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_002944	CGA	2	6	39935	39940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_002944	GA	3	6	39955	39960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_002944	GTC	2	6	39997	40002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_002944	GGT	2	6	40036	40041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406132
1061	NC_002944	GGGC	2	8	40059	40066	0 %	0 %	75 %	25 %	41406132
1062	NC_002944	TTA	2	6	40101	40106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	41406132
1063	NC_002944	ACG	3	9	40107	40115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406132
1064	NC_002944	ACG	2	6	40146	40151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406132
1065	NC_002944	GCT	2	6	40159	40164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406132
1066	NC_002944	GCG	2	6	40175	40180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406132
1067	NC_002944	GAC	2	6	40183	40188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406132
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1069	NC_002944	CGC	2	6	40240	40245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406132
1070	NC_002944	GCT	2	6	40282	40287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406132
1071	NC_002944	CGC	2	6	40315	40320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406132
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1073	NC_002944	GC	3	6	40411	40416	0 %	0 %	50 %	50 %	41406132
1074	NC_002944	TGG	2	6	40470	40475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406132
1075	NC_002944	GC	3	6	40504	40509	0 %	0 %	50 %	50 %	41406132
1076	NC_002944	GCT	2	6	40513	40518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406132
1077	NC_002944	ACA	2	6	40554	40559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406132
1078	NC_002944	CAA	2	6	40733	40738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406132
1079	NC_002944	GGC	2	6	40741	40746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406132
1080	NC_002944	TGG	2	6	40752	40757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406132
1081	NC_002944	AGG	2	6	40770	40775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406132
1082	NC_002944	GAT	2	6	40813	40818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406132
1083	NC_002944	GAG	2	6	40820	40825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406132
1084	NC_002944	CGC	2	6	40832	40837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406132
1085	NC_002944	ATC	2	6	40853	40858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406132
1086	NC_002944	CGC	2	6	40903	40908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406132
1087	NC_002944	CGG	2	6	40912	40917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406132
1088	NC_002944	CCG	2	6	40938	40943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406132
1089	NC_002944	CTG	2	6	41039	41044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406132
1090	NC_002944	CTC	2	6	41089	41094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406132
1091	NC_002944	CTA	2	6	41101	41106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406132
1092	NC_002944	CGC	3	9	41162	41170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406132
1093	NC_002944	TGC	2	6	41190	41195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406132
1094	NC_002944	ACC	2	6	41211	41216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406132
1095	NC_002944	CGG	2	6	41232	41237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406132
1096	NC_002944	GC	3	6	41309	41314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1097	NC_002944	CGGC	2	8	41408	41415	0 %	0 %	50 %	50 %	41406133
1098	NC_002944	CG	3	6	41425	41430	0 %	0 %	50 %	50 %	41406133
1099	NC_002944	GA	3	6	41433	41438	50 %	0 %	50 %	0 %	41406133
1100	NC_002944	GCC	2	6	41467	41472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406133
1101	NC_002944	CAT	2	6	41487	41492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406133
1102	NC_002944	GCG	2	6	41513	41518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406133
1103	NC_002944	AGA	2	6	41546	41551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406133
1104	NC_002944	CGGGCT	2	12	41559	41570	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	41406133
1105	NC_002944	GCC	2	6	41571	41576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406133
1106	NC_002944	TGG	2	6	41597	41602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406133
1107	NC_002944	CCG	2	6	41603	41608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406133
1108	NC_002944	CGG	2	6	41648	41653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406133
1109	NC_002944	CGGCG	2	10	41663	41672	0 %	0 %	60 %	40 %	41406133
1110	NC_002944	ACCGG	2	10	41674	41683	20 %	0 %	40 %	40 %	41406133
1111	NC_002944	TGG	2	6	41684	41689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406133
1112	NC_002944	ATCG	2	8	41761	41768	25 %	25 %	25 %	25 %	41406133
1113	NC_002944	ACA	2	6	41779	41784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406133
1114	NC_002944	TCTG	2	8	41808	41815	0 %	50 %	25 %	25 %	41406133
1115	NC_002944	GCT	2	6	41841	41846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406133
1116	NC_002944	CGC	2	6	41847	41852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406133
1117	NC_002944	GGC	2	6	41897	41902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406133
1118	NC_002944	CCA	2	6	41960	41965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406133
1119	NC_002944	GC	4	8	41972	41979	0 %	0 %	50 %	50 %	41406133
1120	NC_002944	GTC	2	6	42000	42005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406133
1121	NC_002944	CAT	2	6	42018	42023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406133
1122	NC_002944	CGA	2	6	42048	42053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406133
1123	NC_002944	G	6	6	42074	42079	0 %	0 %	100 %	0 %	41406133
1124	NC_002944	GTGC	2	8	42106	42113	0 %	25 %	50 %	25 %	41406133
1125	NC_002944	CGA	3	9	42162	42170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406133
1126	NC_002944	TCA	2	6	42215	42220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406134
1127	NC_002944	CGG	2	6	42230	42235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406134
1128	NC_002944	CGG	2	6	42323	42328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406134
1129	NC_002944	GCA	2	6	42344	42349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406134
1130	NC_002944	CGC	2	6	42386	42391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406134
1131	NC_002944	GACC	2	8	42395	42402	25 %	0 %	25 %	50 %	41406134
1132	NC_002944	GC	3	6	42412	42417	0 %	0 %	50 %	50 %	41406134
1133	NC_002944	GCCG	2	8	42465	42472	0 %	0 %	50 %	50 %	41406134
1134	NC_002944	CGC	2	6	42479	42484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406134
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1136	NC_002944	GCG	2	6	42521	42526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406134
1137	NC_002944	GTG	2	6	42561	42566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406134
1138	NC_002944	CGG	2	6	42568	42573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406134
1139	NC_002944	ACC	2	6	42589	42594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406134
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1141	NC_002944	GGCC	2	8	42644	42651	0 %	0 %	50 %	50 %	41406134
1142	NC_002944	CGGGC	2	10	42656	42665	0 %	0 %	60 %	40 %	41406134
1143	NC_002944	CG	3	6	42672	42677	0 %	0 %	50 %	50 %	41406134
1144	NC_002944	GCC	2	6	42712	42717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406134
1145	NC_002944	G	6	6	42727	42732	0 %	0 %	100 %	0 %	41406134
1146	NC_002944	CAC	2	6	42809	42814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406134
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1149	NC_002944	CAA	2	6	42974	42979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406134
1150	NC_002944	CCGA	2	8	42992	42999	25 %	0 %	25 %	50 %	41406134
1151	NC_002944	ACG	2	6	43033	43038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1154	NC_002944	CGGCG	2	10	43121	43130	0 %	0 %	60 %	40 %	41406135
1155	NC_002944	CGG	2	6	43177	43182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406135
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1161	NC_002944	GCA	2	6	43456	43461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1162	NC_002944	CGGG	2	8	43520	43527	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1163	NC_002944	ACG	2	6	43541	43546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406136
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1165	NC_002944	CGG	2	6	43631	43636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406136
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1169	NC_002944	GCG	2	6	43783	43788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406136
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1206	NC_002944	CCGTC	2	10	45115	45124	0 %	20 %	20 %	60 %	41406137
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1229	NC_002944	CGG	2	6	45740	45745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1236	NC_002944	TCGG	2	8	45928	45935	0 %	25 %	50 %	25 %	41406139
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1238	NC_002944	GTGCG	2	10	46219	46228	0 %	20 %	60 %	20 %	41406139
1239	NC_002944	CGA	2	6	46240	46245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406139
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1247	NC_002944	CGG	3	9	46422	46430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406139
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1250	NC_002944	CGG	2	6	46495	46500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406139
1251	NC_002944	GCC	2	6	46584	46589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406139
1252	NC_002944	CAC	2	6	46622	46627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406139
1253	NC_002944	GCC	2	6	46633	46638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406139
1254	NC_002944	CGC	2	6	46688	46693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406139
1255	NC_002944	GGC	2	6	46703	46708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406139
1256	NC_002944	GTC	2	6	46737	46742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406139
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1368	NC_002944	CAA	2	6	50140	50145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1369	NC_002944	CGA	2	6	50187	50192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1370	NC_002944	ATG	2	6	50206	50211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1371	NC_002944	GCC	3	9	50219	50227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406143
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1383	NC_002944	TGG	2	6	50608	50613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406143
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